中学三年生にタイムスリップ。過去の世界と思いきや、ちょっと違うパラレルワールド。推薦され、怪しげな魔法学術院附属高等学校へと進学する。このパラレルワールドには一人一人の魂に宿ると言われる根源術式と血統により発現する血統魔法が存在する。その力でダンジョンと呼ばれる未知の大穴のその先へ進んでいく。