匿名ハッカー集団【アペイロン】のリーダーたる遠山大河は、一流ハッカーながら元傭兵の武闘派であった。 完全記憶能力を持つ幼馴染みのリサと共に、ハッカー集団を立ち上げた大河。仲間を集め、リサの才能を狙う敵を倒したり、権力者の不正を暴いたりしていく。 だが、その影にはリサが基本設計に関わった超高度AI【アイリス】がいた。 人類抹殺のため暴走を始めたアイリスの意図とは何なのか？ 世界最強ハッカー集団と人工知能のバトルが始まる。