俺は目覚めると「箱庭学園で育むモノ」の主人公として転生していた。 日付を確認すれば転入の三日前、睡眠時間を削り繰り返しプレイしていた世界の主人公になれたことに歓喜するもヒロインと出会い、交流を深めていくにつれて違和感を覚え始める。 気のせいかとも思ったが時間が過ぎるほど原作との違いが浮き彫りになっていき、俺はそれによって起こる問題に奔走することになる。