脳に直接接続するデバイス、精神核計算機により人類の技術の進歩は爆発的に加速した。にもかかわらず、精神核計算機そのものの進歩は若き天才科学者久世美玲の失踪から完全に止まっていた。美玲の弟、久世由良は精神核計算機の違法改造の調査を通じ、姉の行方とその裏に隠れた秘密を探る。