ある時、世界中の塔がダンジョン化した。東京タワーも例に漏れずダンジョン（迷宮）化し、変貌の時運悪くそこに居合わせた者たちはみな巻き込まれ、消息を絶った――。会社員の許斐士郎も塔の迷宮化で家族を失いし者だった。そんな彼の元へ、一人の見知らぬ女子高生・灯里が尋ねてくる。彼女も迷宮に家族を飲み込まれた者であり、その家族を捜索するため、一緒に迷宮へと潜って欲しいというのだが……かくして、士郎は灯里と共に迷宮へと挑むことを決意するのだった。