機械種族『コーヴァ』と人間が共存する世界。 正体不明の巨大な戦艦の中に建てられた国『トリスタン』で コーヴァ族の『オッド』は３年前、終戦の立役者である『ジェネシス・ウェポン』に 改造される前の記憶を取り戻すため、大企業『M3』を調査していた。 そこで見つけたのは人体実験をされている子供たち… オッドは子供たちを救出しM3を阻止することができるのか？