時計に支配された街、クロノポリス。そこに住む少女レインは、街の不自然さに違和感を覚えていた。ある日、彼女は街の秘密を知ることになる。クロノポリスは本来、時間に縛られない自由な街だったのだ。 　レインには特別な力があった。「永遠の一瞬」を感じ取る力。その力を使い、彼女は街を本来の姿に戻そうと決意する。しかし、そこには大きな犠牲が伴っていた……。