上空１千㍍に浮かぶ空中都市「エデン」に暮らすヒューマノイド「ハガネ」が世界を支配し、地上の人間を管理する近未来。人間が存亡をかけた最後の戦いを始める日、戦いの鍵を握る青年レンは、エデンから身投げしたハガネの少女エルザと出会う。次第に惹かれ合う２人だが、エルザにもレンにも秘密があり…。