山が丘第二高校に入学した宮田 玲 (みやた れい)は、人の足跡の残影を見ることができる少女、綾坂 奏(あやさか かなで)と出会う。
入る部活を探していると、人の心を研究する部活「心研部」という不思議な部活動を発見する。
そして、部長の畑原 怜史郎 (はたけばら れいしろう) と共に依頼を解決することになる