魔力を持つ『持つ者』と、魔力をほとんど持たない『持たざる者』との第三次戦争が停戦になって数年後。軍人に憧れていた少女、アテネ・ユリウスは『ライサルト国立士官学校・特殊兵装科』に入学を果たし、軍人への志を追いかける。学園生活を経て、田舎者のチビ少女、高名軍人家系のボンボン、医学学校落ちの堅物青年と出会い、少し変わった青春を謳歌する。 しかし、青春の裏では既に魔の手が幾重にも迫っており……？