大戦が終わり、多くの超巨大企業（メガコープ）によって全てが支配された世界。 大戦時代、侵蝕の傭兵（リキッドソルジャー）と呼ばれた男は、TOE社のフリーエージェントとして敵企業などへの潜入任務をこなしていた。 そんなある日、漆黒の球体の中で、彼は冷たい瞳の少女と出会うーー