とある事故により、眠りについた主人公。目覚めると途方もない未来。普通の男児から銀髪白眼の女の子へ性別も姿も大きく変わってしまった自分がいたのは、文明が破壊され、リセットされた世界だった。事故によって身体に埋め込まれたキューブという謎の物体、特殊能力を身に着けた主人公、魔物や異種族が跋扈する不思議な世界……。主人公は、様々な経験を経て仲間と出会い、世界を巡って人類のあるべき姿へと近づいていく……。