近未来。 突如現れた未知の侵略者『アニヒレーター』。 それにより一度世界は退廃しかけるが、長い年月を経て再び流通経済が整った時代。 日常の一部としてアニヒレーターは襲来する。 過去に例がないほど多数のアニヒレーターが襲来した日。 対アニヒレーター迎撃部隊として設立された組織『ＳＯＤＥ』所属のＴ２と呼称される人型汎用兵器のパイロット・御神有志は新型機『ウィザード』で出撃する。