終末戦争から生き延びた人類は、突然変異で現れた新たな敵『魔族』と対峙する。魔族と戦える魔力を持った人間は僅かで、苦戦を強いる。名門校なみはや学園に所属するA組の生徒たちは、魔力を発動することが出来る選ばれた精鋭たち。人類存続のため、A組の戦いが始まる。