Y染色体、消失。男子、滅亡。――西暦2012年、太陽系に発生した磁気嵐群の影響で、地球上のヒト科のY染色体は絶滅。残された人類は、卵子同士での生殖に成功。地球は女だけの新たな世界に生まれ変わった。だが、運命の西暦3992年。安斎（アンザイ）・Y（イアント）・姫（ヒメ）、誕生。＜彼＞は、世界にたったひとりの男性となった――。