平凡な日常に飽き飽きしていた高校二年生の一ノ瀬渉（いちのせわたる）はある朝の登校中、道端で倒れている一人の少女と出会った。その少女には記憶がなく、ただ一つわかるのは名前がシエルだということだけ。渉は驚きながらも彼女を放っておけず、家で引き取ることにした。どこから来たのか、そして彼女は何者なのか。 世界をまたにかける非日常な学園生活がはじまる―――