蘇った火星の古代種族ネルガルに侵略されてから１５０年が経った地球。ネルガルのダークエナジー技術によって異世界へと変貌してしまった地球で人類は細々と生き延びていた。戦闘用のナノマシンを移植されてナノ・ウィッチとして育った少女エアリーは、人類の存亡をかけて幻の第六世代のナノマシンを探す旅に出る。 サウンドオブソウルシリーズの最後のエピソードが始まる。