月の宇宙ステーション「セレーネ」で科学者の助手として奔走する少女メルルとその相棒兔のラビタ。ある日、博士の薬を買うため街へと繰り出すと、建設中の月掘削機「ルナミキサー」が大きく振動する事故に立ち会い…