第三次世界大戦。 東西とで別れた戦争の結末は核兵器の発射で終焉を迎えた。 運良くどうにかコールドスリープして核の脅威から逃れた少年兵、木之元　セイは何年後かも分からない日本――ヒノモトと名を変えた国に生きる軍属の少女達と出会う。