第二次大戦時、東アフリカでの異星人との会戦、大戦直後のバミューダでの人類同士の戦いを経て、アトランティスと火星の権益を廻る新たな戦いが始まる。Ⅲ号、Ⅳ号人型重機に加え新型Ⅵ号も交え、百目VS石切場の賢人という人類同士の戦いが激化する。果たして石切場の賢人とは何者なのか？アトランティスとはいかなる存在なのか？