幸せそうな顔で亡くなるという急性脳炎に打ち勝つためある研究員が立ち上がる。 突如発症が確認された脳炎。急速に感染が広がるとともに、高い致死率をもっていたことから世界の人口が激減する。 重篤な脳炎により死亡した患者はみな一様に幸せそうな表情を浮かべていた。 日本で著名な感染症研究者、寺岡がこの幸福脳炎と呼ばれる感染症に立ち向かう。 彼の大事な家族に再会するために……