原因不明の『大水没』により、大地のほとんどが水底に沈んだ近未来。 水上に生活の場を移した人類と、狂暴な巨大水棲生物『巨魚（ヒュージフィッシュ）』の脅威。 御神織火（みかみ おるか）は巨魚に全てを奪われた。 失意のままに訪れる旧東京スカイツリー。青く光る海に、悪夢の鱗が再びきらめく―――。