史実ではレイテ湾に向かう途上で沈んだ戦艦武蔵ですが、本作では偶然の積み重ねで生き残り、最終的に沖縄の海岸に座礁します。

海軍からは見捨てられた武蔵でしたが、戦力不足に悩む現地陸軍と手を握り沖縄防衛の中核となります。

無敵の要塞と化した武蔵は沖縄に来襲する連合軍を次々と撃破。その活躍は連合国の戦争計画を徐々に狂わせていきます。