時代は22世紀の未来。
21世紀初頭に生まれたVR技術は目まぐるしい発展を遂げた。
その中でも歴史上の出来事が3Dホログラムの箱庭で鑑賞する事ができ、更に歴史の改変が思うがままに行えるというシミュレーションVR「歴史改変日記」が大ブームを巻き起こしていた。

この「歴史改変日記」を手にした歴史オタクの中学生 佐村大輝（さむら ひろき）は歴史改変を行い、彼が描く理想の歴史を造ろうとしていた。