不慮の事故により目覚めた少年、サダム・コウロギは、わけもわからず駆逐艦ユウナギ号の艦長になっていた。目前に迫る危機をランダム・ワープで切り抜けたものの、跳躍した先は敵領域内の奥深く。偶然救出したバイオロイドの少女シロとともに、サダムは大いなる戦いの渦へと巻き込まれていく。