異能者や魔族、サイボーグやロボット、バイオロイドといった通常の警察力では対処できない事件が続出した現代日本。 これらの事件に対処するため、内務省国家保安局は特別捜査チームを設立する。これは、人々を犯罪から守り、命を守るために犯罪へと立ち向かう捜査官たち、アーマード・デルタの物語である。