유명한 피아니스트의 아들이자 엘리트 음대생인 치아키 신이치는 유럽에서 지휘 공부를 하고 싶어하지만 비행기 공포증 때문에 유럽으로 건너가지 못한다. 그런 그의 앞에 느닷없이 나타난 불가사의한 소녀, 노다메. 쓰레기장 같은 방에서 사는 그녀는 정말 어처구니없는 기인이었다!