柳生新陰流史上、最強の男―― 開祖・石舟斎の孫で、幼少の頃よりの厳しい稽古と類い希なる天賦の才で将来を嘱望されていた柳生の麒麟児・兵介（後の兵庫助）。厳しい剣の道を歩み始めた兵助が十二歳のとき、京都に道場を構える願流の遣い手・根岸矢柄が柳生新陰流に挑戦状を叩きつけてきた。その挑戦を受けるべく、京へ上った兵助たち一行だが…… そこには、凄絶なる死闘が待ち構えていた――。