1999年、ノストラダムスの終末予言の解明に全力を尽くしながらも、謎の組織の妨害により解散に追い込まれた、マガジンミステリー調査班MMR……。しかし、彼らの情熱と探究心は消えていなかった！ 新生MMRが新たな謎に挑む!!